Vou realizar docking molecular e triagem virtual para o seu projeto

Você está trabalhando em um projeto de descoberta de drogas e precisa de resultados confiáveis e reprodutíveis de docking molecular? Seja você um pesquisador, estudante de doutorado ou uma pequena equipe de biotecnologia, posso realizar um fluxo de trabalho completo de docking e entregar resultados claros, prontos para publicação.

Tenho experiência prática em pipelines de design de drogas baseado em estrutura (SBDD), incluindo um estudo completo de docking com 5 ligantes contra a Main Protease do SARS-CoV-2 (PDB: 7SFB), então sei exatamente como é um estudo de docking rigoroso e bem documentado.

O que farei por você:

- Preparar seu alvo proteico (remover moléculas de água, adicionar hidrogênios e cargas Gasteiger)

- Preparar e otimizar seu(s) ligante(s) (minimização de energia, conversão de formato)

- Definir o sítio de ligação / caixa de grade para docking

- Executar o docking usando AutoDock Vina ou PyRx

- Visualizar poses de ligação e interações principais no PyMOL ou Discovery Studio

- Entregar um relatório escrito claro com scores de docking e análise de interações

Os entregáveis incluem:

- Arquivos de saída do docking (PDBQT / SDF)

- Visualizações de poses de ligação de alta qualidade (PNG)

- Resumo escrito dos resultados com interpretação

Ferramentas usadas: AutoDock Vina, PyRx, PyMOL, UCSF Chimera, Discovery Studio