Ver categorias
Explorar
Fiverr Pro
Português
$
USD
Vou realizar análise de bioinformática de dados de microbioma
Análise estatística e bioinformática para biólogos
Sou biólogo e pesquisador especializado em análise estatística, bioinformática, microbiologia e ecologia microbiana. Trabalho com R, DADA2, QIIME2, Phyloseq e QGIS para analisar dados biológicos e amb...
Sobre este Serviço
Precisa de ajuda para analisar dados de microbioma ou amplicons microbianos? Posso ajudar a processar, analisar e interpretar seus dados usando QIIME2, DADA2, Phyloseq e R.
Posso trabalhar com conjuntos de dados de 16S rRNA e outros amplicons microbianos e fornecer:
- Processamento de dados e avaliação de qualidade com QIIME2/DADA2
- Análise de composição taxonômica e diversidade
- Diversidade alfa e beta
- Análise de ordenação e estrutura da comunidade
- Análise estatística e visualizações
- Análise de abundância diferencial quando apropriado
- Figuras de qualidade de publicação e interpretação clara
Você receberá: resultados processados, saídas estatísticas, figuras claras, interpretação dos achados e fluxos de trabalho de análise reproduzíveis, quando incluídos no seu pacote.
Foco em selecionar métodos adequados com base na sua questão de pesquisa, desenho experimental e estrutura dos dados.
Por favor, entre em contato comigo antes de fazer o pedido se não tiver certeza de qual pacote é adequado para seu conjunto de dados ou se precisar de um fluxo de trabalho de bioinformática específico.
Perguntas frequentes
Tradução automática
Que tipos de dados de microbioma você pode analisar?
Posso analisar conjuntos de dados de amplicons microbianos, como dados de 16S rRNA e outros conjuntos compatíveis, usando QIIME2, DADA2, Phyloseq e R. Por favor, entre em contato antes de fazer o pedido se tiver um tipo de dado diferente.
Você consegue analisar arquivos FASTQ brutos?
Sim. Dependendo do pacote, posso trabalhar com arquivos FASTQ brutos e realizar avaliação de qualidade e processamento usando QIIME2 ou DADA2. Forneça informações sobre sua plataforma de sequenciamento, primers e desenho experimental.
Você pode analisar meus dados de microbioma se eu não souber qual método usar?
Sim. Posso revisar sua questão de pesquisa, desenho experimental, metadados e estrutura dos dados e recomendar um fluxo de trabalho de análise adequado.
Vou receber o código da análise?
Código reproduzível pode ser incluído, dependendo do pacote. Posso fornecer scripts em R e fluxos de trabalho de análise relevantes quando aplicável.
Você consegue criar figuras de qualidade de publicação?
Sim. Dependendo do pacote, posso criar figuras claras e prontas para publicação para diversidade, taxonomia, ordenação, estrutura da comunidade e outras análises apropriadas.
Você pode analisar abundância diferencial?
Sim, quando o desenho experimental e os dados suportarem. O método adequado depende do desenho do estudo, número de amostras, metadados e questão de pesquisa.
