Farei análise de dados de bioinformática usando python e r

Sou bioinformata e desenvolvedor em Python/R com mais de 5 anos de experiência processando conjuntos de dados de NGS e desenvolvendo fluxos de trabalho analíticos. Coautor de 15 publicações revisadas por pares (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).

Serviços:

• Análise de Dados de NGS: WGS/WES (GATK, priorização de SNP, detecção de variantes), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), e Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
• Scripting em Bioinformática: Scripts personalizados e desenvolvimento de pipelines em Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) e R (Bioconductor).
• Ferramentas & Ambientes: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
• Visualização de Dados: Figuras prontas para publicação usando Matplotlib, Seaborn, Plotly e ggplot2.

Entregáveis:

• Dados de sequência processados e arquivos de variantes (VCF, BAM, BED, matrizes de contagem).
• Código limpo, documentado e configurações de ambiente reprodutíveis.
• Relatórios resumidos com figuras e interpretações de dados.

Por favor, entre em contato comigo antes de fazer seu pedido para discutir a estrutura dos seus dados e os requisitos do projeto.