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Eu farei análise de expressão diferencial de RNA seq e enriquecimento de vias
bioinformática
Sou especialista em bioinformática e análise baseada em dados, com experiência em dados de NGS em transcriptômica, genômica e metagenômica. Também tenho forte background em ciência de dados e aprendiz...
Sobre este Serviço
Ajudo estudantes e pesquisadores com análise profissional de bioinformática e dados de transcriptômica. Os serviços incluem análise de RNA-seq, expressão diferencial, suporte à análise de variantes, análise estatística, PCA, heatmaps, enriquecimento de vias e visualizações prontas para publicação usando workflows de bioinformática em R, Python e linha de comando Linux. Trabalho com matrizes de contagem processadas, bem como arquivos FASTQ brutos, para conjuntos de dados de pequeno a médio porte. Comunicação clara, resultados organizados e precisão são prioridades em cada projeto. Por favor, entre em contato antes de fazer o pedido para discutir seu conjunto de dados e requisitos do projeto.
Meu portfólio
Perguntas frequentes
Tradução automática
Com que tipos de conjuntos de dados você trabalha?
Trabalho com RNA-seq, transcriptômica, expressão diferencial e conjuntos de dados NGS de pequeno a médio porte. Posso trabalhar com matrizes de contagem processadas ou arquivos FASTQ brutos, dependendo do pacote escolhido.
Quais arquivos preciso fornecer?
Por favor, forneça: arquivos FASTQ ou matriz de contagem metadados da amostra/etiquetas do grupo design experimental informações do organismo/referência (se disponível)
Preciso de conhecimento em bioinformática para fazer o pedido?
Não. Posso ajudar a explicar o workflow, resultados e visualizações de forma clara e adequada para pesquisa.
Você consegue analisar grandes conjuntos de dados?
Para conjuntos de dados maiores ou altamente complexos, entre em contato antes de fazer o pedido para que eu possa revisar os requisitos computacionais e fornecer uma oferta personalizada, se necessário.
Quais resultados vou receber?
Dependendo do pacote, você pode receber: Tabelas de DEG Gráficos de PCA heatmaps volcano plots resultados de enriquecimento de vias relatórios de QC figuras prontas para publicação relatórios resumidos
Quais ferramentas você usa?
Ferramentas comuns incluem: DESeq2 STAR featureCounts R Python Workflows Linux/WSL
Devo entrar em contato com você antes de fazer um pedido?
Sim, especialmente para workflows personalizados, conjuntos de dados grandes, múltiplas comparações ou projetos avançados de transcriptômica.
